20世纪后约1000年，推进到外太空的地球人在与神秘的外星人伊尔米达斯的战斗中败北，逃难的地球人绝望地回到了伊尔米达斯占领下的地球。 在这样的屈辱中，他描绘了向地球发送难民的哈洛克的大山藤一郎与埃梅拉达斯之间的命运相遇，以及与哈洛克一生中唯一爱过的女人玛雅的爱与告别。 它始于对 Harlock 氏族祖先 Phantom F. Harlock 的记忆。